南科指出，
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，因應半導體廠商提高晶圓廠製程，
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，園區平均每日用水量預計從20萬公噸增加為25萬公噸，
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，用電量從152萬瓩 增加為222萬瓩，
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，廢水量也會從16.5萬公噸增加為17.6萬公噸。多出的用水量從哪來？南科規畫在水利署新開發的水資源計畫完成前，
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，暫時從嘉南農田水利會調度水源支應。台灣水資源保育聯盟、荒野保護協會、要健康婆婆媽媽團等團體痛批，
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，南科不應和農民搶水，
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，犧牲農民權益。「這不是賺多賺少的問題，而是能不能活下去的問題」，荒野保護協會台南分會環境培力組長張讚合指出，灌溉用水是農民生命泉源，南科不能剝奪。南科應放棄仰賴水利單位提供水源，應創設「南科水資源回收中心」，自主創造水源，不僅解決水供應的問題，也能降低環境汙染。南科表示，預計2021年園區的用水量才會增加至每日25萬公噸，且必須是加強灌溉後還有剩水，水利會才調撥給南科使用，農民不會無水可用。不過環委對於變更後的詳細內容、影響及期程仍有疑慮，且須提出多元水源開發方案，要求南科補件後審。，