檢方以證人傳喚前國安局長蔡得勝、國安局祕書長袁健生、胡為真、副祕書長鄧振中、陸委會主委王郁琦等高層，
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，除王證詞不利張外，
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，其他人都對張有利。蔡得勝證稱，
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，他任內若辦間諜案都會呈報，
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，不包括張顯耀案。袁健生說，
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，看不出張與大陸往來有異常。檢方還發現，
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，調查局彙整一批張洩密資料，
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，送陸委會鑑定機密等級時，
訴訟困難件
，調查局只拿張參與的兩岸會議、公文名稱，請求鑑定，鑑密過程未就具體公文、會議內容或資料實質鑑定，鑑密過程有瑕疵；此外，將張顯耀參與會議、出訪日期及事先告知友人將接陸委會副主委任命案都列機密，過於浮濫。最離譜是，王郁琦僅憑台商「張與大陸官員走很近，未來可能會出事」一句話，卻答不出台商是誰，什麼場合提醒，也缺檢舉黑函就認定，太草率。而張的助理、司機屬老板及部屬委任關係，2人只是張執行事務輔助人員，張不算洩密2人。且檢方未在張顯耀及陳、李2人以外處所，發現有報告流露在外的事證，認定罪嫌不足，將張顯耀等人不起訴。北檢打臉，調查局內部強烈反彈，他們不滿北檢將追蹤3年案件「整碗捧去」，後期卻不讓調查局插手，質疑檢方盡信張顯耀、蔡得勝說詞，該鑑定沒鑑定、該訊問沒訊問，結案難令人信服，檢調心結浮上檯面。調查局昨罕見發新聞稿表示「尊重」結果，卻意有所指洩密案件「允宜」慎重處理，憂心「檢方如此認定，未來兩岸談判如何進行？」，